Do zakresu działania Działu Nadzoru Fitosanitarnego należą w szczególności:
planowania, koordynacji i nadzoru nad kontrolą fitosanitarną roślin, produktów roślinnych, podłoży i gleby oraz środków transportu na terenie województwa, oceny stanu zagrożenia roślin przez organizmy szkodliwe, prowadzenia ewidencji organizmów szkodliwych, przygotowywania decyzji administracyjnych z zakresu nadzoru fitosanitarnego, prowadzenia rejestru przedsiębiorców, nadzoru nad prawidłowością wydawania paszportów roślinnych i etykiet przez komórki organizacyjne Wojewódzkiego Inspektoratu, nadzoru nad urzędową kontrolą u zarejestrowanych przedsiębiorców, nadzoru nad prawidłowością wystawiania świadectw fitosanitarnych, ustalania i doskonalenia metod oraz terminów zwalczania organizmów szkodliwych, nadzoru nad przestrzeganiem procedury pobierania prób gleby, podłoża, roślin, produktów roślinnych i przedmiotów do badań laboratoryjnych, nadzoru nad kontrolą zabiegów oczyszczania, odkażania i przerobu roślin, produktów roślinnych i przedmiotów, nadzoru nad wprowadzaniem, rozprzestrzenianiem oraz nad pracami z wykorzys-taniem organizmów kwarantannowych, roślin, produktów roślinnych lub przedmiotów porażonych przez organizmy kwarantannowe, wyznaczania stref porażenia, bezpieczeństwa oraz stref zagrożenia w przypadku wystąpienia określonych organizmów kwarantannowych, nadzoru nad dofinansowaniem kosztów zwalczania bakteriozy pierścieniowej i raka ziemniaka, nadzoru nad wprowadzaniem do zintegrowanego systemu informatycznego danych z przeprowadzonych obserwacji i kontroli upraw pod kątem występowania organizmów niekwarantannowych i kwarantannowych, wystawianych świadectw fitosanitarnych, wydanych decyzji administracyjnych, prowadzenia szkoleń dla pracowników Wojewódzkiego Inspektoratu, opracowywania, przygotowywania sprawozdań i informacji z wykonywania zadań w zakresie nadzoru fitosanitarnego, koordynacji i nadzoru nad urzędową kontrolą roślin, produktów roślinnych i przedmiotów na drogach i w środkach transportu, nadzoru nad realizacją spraw związanych ze zdrowiem roślin w Oddziałach.